難病に苦しむ孫の医療費を稼ぐため、政府公認の暗殺組織“ＳＳ機構”に再就職した平賀雷蔵。彼はそこで１１歳の殺し屋・涼風美晴と出会い、コンビを組む事となる。法で裁けない悪人を葬るべく、暗殺計画を実行していく２人。やがて雷蔵は、美晴が杉並弁護士一家殺害事件の被害者であり、その黒幕である無双三郎に復讐を果たそうとしている事を知る。裏社会を牛耳る“大いなる絆”の頂点に君臨する無双三郎を暗殺できるのか‥‥！？